mNGS快速诊断罕见中枢、血液双系统混合感染

导 读

近期,常州市第三人民医院感染科徐天敏教授团队与迪飞医学合作,于24年1月在BMC Infectious Diseases(IF=3.7)杂志发表一例罕见病例报告,患者中枢神经、血液系统合并感染戊型肝炎病毒(HEV)和肺炎克雷伯菌,mNGS在混合感染诊断中优势凸显。

研究背景

HEV是全世界(尤其是发展中国家)急性病毒性肝炎的主要原因,极少数情况下也会进入脑脊液,导致中枢神经系统感染。肺炎克雷伯菌作为常见的医源性感染病原体,易感染免疫受损人群。迄今为止,尚未报道HEV和肺炎克雷伯菌同时感染的病例。

本例中患者存在HEV和肺炎克雷伯菌合并感染中枢神经系统和血液系统,起病急、病程进展快。借助mNGS及时准确的检测,临床针对性治疗后,患者好转出院。

病例介绍

当地医院诊疗过程

患者男性,68岁,有40年支气管扩张病史,多次服用环丙沙星、阿莫西林治疗支扩继发感染。2023年4月5日因“突然发烧、头痛,颈部略微僵硬”就诊于当地金坛市人民医院,生化指标谷丙转氨酶和谷草转氨酶明显升高,提示肝功能异常。头颅MRI显示老年质脑改变,双侧蝶窦炎。当地医院行血培养。

常州三院诊疗过程

入院诊断和治疗

2023年4月7日患者转院至常州第三人民医院,初步诊断为中枢神经感染和肝功能不全。入院后最高体温达40℃,头痛明显,并出现黄色水样腹泻。WBC、PCT、CRP和II-6等炎症指标明显升高。

入院后予异苷草酸镁注射液(150mg qd)和多烯磷脂酰胆碱注射液(697.5mg qd )进行保肝治疗,予甘露醇(150ml q6h)和甘油果糖(150ml q12h)以降低颅内压,予利奈唑胺葡萄糖(0.6g q12h)和美罗培南注射液(2g q8h)进行经验性抗感染治疗,予地塞米松注射液5mg qd抗炎7天,口服布拉氏酵母菌散(0.5g bid)调节肠道菌群。

进一步检查和治疗

4月8日,行腰椎刺穿术采集脑脊液。脑脊液外观呈浅黄色,常规检测显示WBC计数增加、以多核细胞为主,蛋白升高,葡萄糖和氯化物降低,提示中枢神经感染,怀疑为化脓性脑膜炎。同时戊型肝炎病毒IgM为8.086 S/co,提示患有戊型肝炎。进一步送检脑脊液和血液样本同时进行培养和mNGS检测。

4月9日,mNGS结果回报,脑脊液和血液样本中均检出HEV和肺炎克雷伯菌。同时HEV RNA 定量结果显示血液中含量为1.8E+04copy/ml,粪便中含量为8.4E+03copy/ml。遂停用利奈唑胺,继续注射美罗培南抗感染。4月19日当地医院血培养结果回报肺炎克雷伯菌阳性,药敏提示仅氨苄西林耐药,故调整抗生素,降阶梯为头孢他啶注射液。

图1 脑脊液样本中肺炎克雷伯菌和HEV的基因组覆盖图

转归和预后

经治疗,患者体温恢复正常,头痛减轻,复查炎症指标逐步下降,肝功能好转。

4月18日,再次行腰椎刺穿术,复查脑脊液外观无色清亮,炎症指标下降。

4月19日,复查血液和粪便样本HEV RNA 定量,结果均为阴性。

4月26日,患者好转出院。

总 结

1. 本案例首次报道了一例HEV和肺炎克雷伯菌合并感染中枢神经系统和血液系统的罕见病例。

2. HEV感染造成肝功能严重受损,可能会引起HEV和其他机会性病原体透过血脑屏障,导致严重的中枢神经系统感染。

3. 中枢神经系统感染一般起病急、进展快。在本例混合感染病例中,mNGS体现了其无偏向、广覆盖、高时效的特点。

该研究使用了迪飞医学mNGS检测技术。

参考文献:

Cui M, Sun W, Xue Y, Yang J, Xu T. Hepatitis E virus and Klebsiella pneumoniae co-infection detected by metagenomics next-generation sequencing in a patient with central nervous system and bloodstream Infection: a case report. BMC Infect Dis. 2024 Jan 2;24(1):33. doi: 10.1186/s12879-023-08850-4. PMID: 38166638; PMCID: PMC10763291.